Array name	Sample name	Batch	Covariate 1
GSE23993_ESC_serum_1	GSE23993_ESC_serum_1	5	primed
GSE23993_ESC_serum_2	GSE23993_ESC_serum_2	5	primed
GSE23993_ESC_serum_3	GSE23993_ESC_serum_3	5	primed
GSE26900_ESC_serum_1	GSE26900_ESC_serum_1	3	primed
GSE26900_ESC_serum_2	GSE26900_ESC_serum_2	3	primed
GSE26900_ESC_serum_3	GSE26900_ESC_serum_3	3	primed
GSE26900_ESC_serum_4	GSE26900_ESC_serum_4	3	primed
GSE26900_ESC_serum_5	GSE26900_ESC_serum_5	3	primed
GSE26900_ESC_serum_6	GSE26900_ESC_serum_6	3	primed
GSE32464_ESC_2i_1	GSE32464_ESC_2i_1	4	naive
GSE32464_ESC_2i_2	GSE32464_ESC_2i_2	4	naive
GSE32464_ESC_2i_3	GSE32464_ESC_2i_3	4	naive
GSE35983_ESC_serum_1	GSE35983_ESC_serum_1	1	primed
GSE35983_ESC_serum_2	GSE35983_ESC_serum_2	1	primed
GSE35983_ESC_serum_3	GSE35983_ESC_serum_3	1	primed
GSE35983_ESC_2i_1	GSE35983_ESC_2i_1	1	naive
GSE35983_ESC_2i_2	GSE35983_ESC_2i_2	1	naive
GSE35983_ESC_2i_3	GSE35983_ESC_2i_3	1	naive
GSE40192_ESC_serum_1	GSE40192_ESC_serum_1	6	primed
GSE40192_ESC_serum_2	GSE40192_ESC_serum_2	6	primed
GSE40192_ESC_serum_3	GSE40192_ESC_serum_3	6	primed
GSE45509_ESC_2i_1	GSE45509_ESC_2i_1	2	naive
GSE45509_ESC_2i_2	GSE45509_ESC_2i_2	2	naive
GSE45509_ESC_2i_3	GSE45509_ESC_2i_3	2	naive
GSE45509_ESC_2i_4	GSE45509_ESC_2i_4	2	naive
GSE45509_ESC_2i_5	GSE45509_ESC_2i_5	2	naive
GSE45509_ESC_2i_6	GSE45509_ESC_2i_6	2	naive
GSE46227_EpiSC_1	GSE46227_EpiSC_1	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_2	GSE46227_EpiSC_2	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_3	GSE46227_EpiSC_3	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_4	GSE46227_EpiSC_4	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_5	GSE46227_EpiSC_5	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_6	GSE46227_EpiSC_6	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_7	GSE46227_EpiSC_7	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_8	GSE46227_EpiSC_8	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_9	GSE46227_EpiSC_9	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_10	GSE46227_EpiSC_10	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_11	GSE46227_EpiSC_11	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_12	GSE46227_EpiSC_12	7	EpiSC
GSE46227_EpiSC_13	GSE46227_EpiSC_13	7	EpiSC
GSE46227_ESC_serum_1	GSE46227_ESC_serum_1	7	primed
GSE46227_ESC_serum_2	GSE46227_ESC_serum_2	7	primed
GSE46227_ESC_serum_3	GSE46227_ESC_serum_3	7	primed
GSE48476_EpiSC_1	GSE48476_EpiSC_1	8	EpiSC
GSE48476_EpiSC_2	GSE48476_EpiSC_2	8	EpiSC
GSE48476_EpiSC_3	GSE48476_EpiSC_3	8	EpiSC
GSE48476_EpiSC_4	GSE48476_EpiSC_4	8	EpiSC